Evaluation of rice cultivars for resistance to rice yellow mottle virus

Rice yellow mottle virus (RYMV), which is only found in Africa, threatens rice farming on the continent. A local Oryza sativa cultivar collected from Burkina Faso (named BM24), was evaluated with that of well known highly resistant and tolerant cultivars. Firstly, three RYMV isolates were used to characterise the differential interaction within the cultivars. Secondly, disease kinetics of symptom expression and virus titer on leaves at 21 days after inoculation were assessed using the BF1 isolate. Thirdly, the allelic profile of O. sativa varieties using SSR marker RM101 located on chromosome 12 was also assessed. IR64 showed susceptibility to all isolates; while Tog5681 was resistant to all isolates. Ng122 overcame the resistance of Gigante, with mild leaf symptoms at 42 dpi. Azucena and BM24 had, therefore, different resistance level regarding the three isolates (Ng117b, Ng122 and Ng144). When infected with the isolate, BF1, BM24 and Azucena exhibited same resistance patterns in early growth stages with delayed of symptoms appearance, but BM24 outperformed Azucena at later stages. The virus content in the two accessions, at 14 days post inoculation, was statistically different with BM24, showing less virus compared to Azucena. However, the two accessions depicted an identical allelic profile at RM101 locus

Caractérisation du système de production du gingembre (Zingiber officinale Rosc.) au Burkina Faso : Potentialités, contraintes et perspectives

Le gingembre est une herbacée annuelle. C’est l’une des plus importantes épices à travers le monde et est d’une importance économique avec de nombreuses vertus médicinales. Cette étude vise à  caractériser le système de production du gingembre (Zingiber officinale Rosc.) au Burkina Faso dans le but de mieux faire connaître l’espèce et de mettre en exergue ses potentialités.. Les informations collectées à l’aide des fiches d’enquêtes ont permis de décrire avec exactitude la zone de production de l’espèce et de caractériser le système de production au Burkina Faso. Le gingembre a été introduit au Burkina Faso il y a plusieurs dizaines d’années et est communément appelé « gnamankou ». La plante est cultivée essentiellement dans la partie Sud-Ouest du pays où les précipitations annuelles sont comprises entre 900 et 1200 mm. La culture du gingembre est peu répandue et se pratique généralement aux abords des bas-fonds sur de petites superficies. Les pratiques culturales adoptées ne suivent aucun itinéraire technique établit avec des moyens de production souvent dérisoires. Sa production est limitée malgré ses nombreuses potentialités médicinales et économiques. Les institutions en charge de l’agriculture ne disposent pas de données concernant la culture du gingembre.Mots clés : Culture, enquête, pratique culturale, cultivar, génétique

Diversité des insectes actifs au sol dans quatre écosystèmes de bas-fonds du Burkina Faso : importance pour la détermination de bio-indicateurs caractérisant ces milieux

L'action de l’Homme sur l'environnement peut affecter la diversité biologique qui à son tour peut être utilisée comme indicateur de la santé des écosystèmes. Une étude a été menée en 2006 dans quatre (4) MicroBassin-Versants (MBV) du Burkina Faso pour évaluer la diversité des insectes rampants au sol et caractériser chaque écosystème par ses bio-indicateurs les plus significatifs. La diversité taxonomique des espècesd’insectes capturées dans différents sites par des pièges de Barber, leur distribution et leur abondance relative au début et à la fin de la saison des pluies ont ainsi été déterminées. Quatre (4) ordres regroupant treize (13)familles d’insectes, les Carabidae, les Scarabaeidae, les Tenebrionidae, les Cétonidae, les Cérambycidae, les Curculionidae, les Hydrophilidae, les Elateridae, les Staphylinidae, les Chrysomelidae (Coléoptères), lesFormicidae (Hyménoptères), les Gryllidae (Orthoptères) et les Labiduridae (Dermaptères), ont été identifiées dans les MBV étudiés. Les variations climatiques influencent la diversité taxonomique des insectes qui fluctuepar ailleurs dans l’espace et dans le temps. Cinq (5) familles, les Formicidae, les Cicindellidae, les Carabidae, les Scarabaeidae et les Tenebrionidae ont été les plus abondantes et les plus diversifiées en espèces dans chacun des quatre MBV. Ces taxa, qui se sont adaptés aux écosystèmes étudiés, en sont probablement les meilleurs indicateurs. Les résultats obtenus sont discutés en vue de déterminer comment ces groupes majeurs peuvent être utilisés dans l’évaluation et la gestion des écosystèmes qu’ils peuplent

Aspects épidémiologiques et étiologiques des affections pulmonaires d’origine parasitaire et fongique en milieu hospitalier à Ouagadougou (Burkina Faso)

Dans le souci de déterminer l’aspect épidémiologique et étiologique des affections pulmonaires d’origines parasitaire et fongique, une étude prospective transversale a été réalisée en milieu hospitalier à Ouagadougou de novembre 2012 en mai 2013, sur 103 patients suspectés avoir la maladie. Les examens parasitologiques, mycologiques et immunologiques ont été effectués selon les indications des prescripteurs, sur des prélèvements du liquide de lavage broncho-alvéolaire, du liquide pleural, des expectorations et du sang. A l’issue de ces examens, 59,2% des patients confirmés porteurs de parasites et/ou de mycètes dans leur appareil pulmonaire avec une prédominance des cultivateurs (26,2%) ont été détectés. Les hommes étaient les plus touchés avec un sex-ratio de 1,9. Parmi les antécédents médicaux, il y a eu une fréquence élevée des sujets à sérologie VIH positive. Trois parasites et 71 souches de champignons ont été isolés dont 4 types de coinfections fongiques. Ces données de bases montrent que les parasites et les champignons provoquent une pathologie pulmonaire non spécifique sur le plan clinique, radiologique et endoscopique. Le contexte épidémiologique et biologique permet d’orienter le diagnostic. La confirmation est apportée par la mise en évidence directe ou par des arguments indirects sérologiques. Ce qui permet d’obtenir une guérison par un traitement adapté au germe en cause.Mots clés : Affection pulmonaire, parasites, champignons, Burkina Faso

Dynamique d’offre de fourrages relative a l’environnement : Facteurs explicatifs sur les marches du Benin et du Burkina Faso

Les changements climatiques accentuent la pression sur les ressources naturelles et interrogent le potentiel fourrager disponible en zones pastorales pour l’alimentation des ruminants, en particulier celle des bovins et ovins. La présente étude a examiné les facteurs qui influencent l’offre de fourrages, en relation avec l’environnement, sur les marchés du Bénin et du Burkina-Faso. Au total, 272 vendeurs de fourrages ont été enquêtés de façon aléatoire et et en boule de neige dans l’ensemble de la zone d’étude. Le modèle de régression linéaire multiple estimé par les Moindres Carrés Ordinaires a permis d’identifier les facteurs qui affectent l’offre de fourrages dans la zone d’étude. En effet, les zones agro-écologiques, la distance de recherche de fourrages, le prix du fourrage, les caractéristiques des vendeurs et le coût du transport sont les facteurs décisifs qui influencent significativement le niveau d’offre de fourrages dans l’ensemble de la zone d’étude. Toutefois, la zone agro-écologique nord-soudanienne et l’expérience du vendeur dans la collecte du fourrage affectent significativement et positivement la quantité de fourrage offerte au Burkina Faso tandis que la zone agro-écologique I et la distance de recherche de fourrages ont un effet positif et significatif sur l’offre de fourrages au Bénin. La prise en compte de ces facteurs dans les politiques agricoles et actions de développement permettrait d’améliorer l’offre de fourrages et par ricochet la production animale.Mots clés : Déterminants, disparités environnementales, MCO, offre fourragère, Bénin et BurkinaFaso Dynamics of feedstuff’s supply under environmental dimension: determinant factors on Benin and Burkina Faso markets (West Africa)The present study analyses the factors influencing the feedstuff’s supply on the markets of Bénin and Burkina Faso, in relation with environnemental disparity. A sample of 272 feedstuff’s selters was randomly and by snowball selected for a survey. The regression model estimated by OLS allowed to identify the factors that affect the supply of feedstuffs in the study area.As results, the agro-ecological zones, the feedstuffs search distance, feedstuff’s price, the characteristics of the sellers and the cost of transport are the decisive factors that significantly influence the level of forage supply in the study area. However, the North-Sudanese agro-ecological zone and the sellor’s experience in fodder collection significantly and positively affect the level of feedstuffs offered in Burkina Faso while the agroecological zone I and feedstuffs search distance have a positive and significant effect on the supply of feedstuffsin Benin. Considering these factors in agricultural policies and development actions, will lead to improving feedstuffs supply and indirectly the animal production.Keywords: Determinants, environmental disparities, OLS, feedstuffs supply, Benin and Burkina Faso

Polymerase Chain Reaction (PCR) provides a superior tool for the diagnosis of Pneumococcal Infection in Burkina Faso

Purpose of study: The aim of this study was to determine the value of real-time Polymerase Chain Reaction (rt-PCR) in the routine surveillance of pneumococcal meningitis in Burkina Faso, compared to standard methods of culture, Gram stain and latex agglutination assay.Materiel and methods: A total of 385 specimens of cerebrospinal fluid were analyzed by the three standard bacteriological methods (Gram stain, latex agglutination assay, and culture) and real-time Polymerase Chain Reaction.Results: Of 385 specimens analyzed by these methods, 204 S. pneumoniae were detected by one or more  methods. Gram stain detected 36.4% (140/385) Gram positive encapsulated diplococci; 37.7% (145/385) and 20.8% (80/385) of the specimens were positive for pneumococci by latex agglutination assay and culture. These specimens were tested with rt-PCR, which confirmed 51.2% (197/385) S. pneumoniae positive. The sensitivity and specificity of culture were 54.4% and 31.5%, respectively, and the sensitivity and specificity of rt-PCR were 96.6% and 100%, respectively. These results showed that rt-PCR was more sensitive than Gram stain (p=0.0235), latex agglutination assay (p=0.0442)and culture (p=0.0006).The culture is the gold standard method; however, the result showed that rt-PCR had specificity and was as specific as Gram stain (p=0.3405) and latex agglutination assay (p=0.7745).Conclusion: rt-PCR was highly sensitive and specific. It could be used as a complementary diagnostic tool to  mprove case confirmation of bacterial meningitis. However,its high cost, the qualification of the technical staff and infrastructures required for its implementation, constitute obstacles to its widened use in countries with limited resources.Keywords: Streptococcus pneumoniae, meningitis, rt-PCR, standard bacteriological methods Objectif: Le but de cette étude était de déterminer la place de la rt-PCR dans la surveillance de routine deméningitespneumococciquesau Burkina Faso et la comparée avec les méthodes de la bactériologie classique: Culture, coloration de Gram et l’agglutination au latex.Matériel etméthodes: Au total, 385 échantillons deliquides céphalorachidiens (LCR)étaient analysés par les trois méthodes de la bactériologie classique (coloration de Gram, agglutination au latex, culture) et la PCR en temps réel.RESULTATS: Parmi 385 échantillons analysés, 204 cas de Streptococcuspneumoniae étaient détectés par une ou plusieurs méthodes. La coloration de Gram adétecté 36,4% (140/385) diplocoques encapsulés à Gram positif (DGP); 37,7% (145/385) et 20,8% (80/385) d’échantillons étaient positifs aux pneumocoques par l’agglutination au latex et la culture. Ces échantillons étaient aussi testés par rt-PCR qui a confirmé 51,2% (197/385) cas positifs de S. pneumoniae. La sensibilité et la spécificité de la culture étaient respectivement de 54,4% et 31,5%, et la sensibilité et la spécificité de rt-PCR étaient respectivement de 96,6% et 100%. Ces résultats ont montré que la rt-PCR était plus sensible que la coloration de Gram (p=0,0235), l’agglutination au latex (p=0,0442) et la  culture(p=0,0006).La culture est une méthode de référence; cependant, le résultat a montré que rt-PCR était plus sensibleet aussi spécifique que la coloration de Gram ((p=0,3405)et l’agglutination au latex (p=0,7745).Conclusion : :rt-PCR était plus sensible et plus spécifique. Elle pourrait être utilisée comme un outil de diagnosticcomplémentaire pour améliorer les cas de confirmation de méningites bactériennes. Cependant, ces coûts de réalisation, la qualification de techniciens et les matériels pour son application constituent des obstacles pour sa vulgarisation dans les pays à ressources limités.Keywords: Streptococcus pneumoniae, méningites, rt-PCR, méthodes de la bactériologie classique Article in English

Effects of a four-year health systems intervention on the use of maternal and infant health services: results from a programme evaluation in two districts of rural Chad

BACKGROUND: Attendance of maternal and infant care services in rural Chad are consistently low. Our study aimed to assess the use of antenatal (ANC) and postnatal care (PNC) services, health facility delivery and infant health services after 4 years of a health systems intervention for improving the infrastructure, supplies, training and sensitization for maternal and infant health in two districts of rural Chad. METHODS: Data from a repeated cross-sectional household survey conducted in Yao and Danamadji in 2015 and in 2018 were analyzed. A stratified two-stage cluster sampling methodology was applied to achieve a representative sample of the rural settled and mobile population groups in the study area. A generalized linear model was applied to determine the health care utilization rates. Multivariate regression models were used to assess the association between the programme intervention and utilization outcomes of selected maternal and infant health services. RESULTS: Complete datasets were available for 1284 households at baseline. The endline analysis included 1175 households with complete survey data. The use of at least one ANC amongst pregnant women increased in both settled communities (from 80% in 2015 to 90% in 2018) and amongst mobile pastoralist communities (from 48% in 2015 to 56% in 2018). The rate of home delivery among settled communities and mobile pastoralists changed little between baseline and endline and remained high for both population groups. Individuals that were covered by the health systems intervention were however significantly more likely to attend ANC and less likely to give birth at home. PNC services only showed improvements amongst the settled communities (of 30%). Infants' reported health outcomes and vaccination coverage considerably improved; the latter especially among mobile pastoralist (from 15% in 2015 to 84% in 2018). CONCLUSION: A combination of health systems strengthening interventions was associated with an increased use of certain maternal and infant health services. However, to facilitate equitable access to and use of health care services in particular in times of increased vulnerability and by certain population groups in hard-to-reach areas, reinforced health education and culturally adapted communication strategies, including gender-specific messaging will be needed over a sustained period

Spasmolytic Effects of Aqueous Extract of Sterculia setigera Delile on Isolated Rat Trachea

The spasmolytic properties of aqueous extract of Sterculia setigera was tested on Rat isolated trachea. Inhibition of the contraction was observed in presence of the aqueous extract (EC50 = 0.91mg/mL ± 0.02) after a pre contraction of the trachea by acetylcholine (10-5M). In the presence of propranolol (10-6M), the spasmolytic activity of the extract was inhibited. The EC50 value was 0.46mg/mL ± 0,11. The aqueous extract of Sterculia setigera also inhibited contraction induced by KCl (4.10-2 M) with EC50 value = 1.9mg/mL ± 0.48).  These results clearly show a relaxing effect of aqueous extract of Sterculia setigera on the trachea isolated from rat. This effect involves at least in part β-adrenergic receptor inhibition

Biological status and dietary intakes ofiIron, zinc and vitamin A among women and preschool children in rural Burkina Faso

Background Food-based approaches such as biofortification are meant to sustainably address micronutrient deficiencies in poor settings. Knowing more about micronutrient intakes and deficiencies is a prerequisite to designing and evaluating interventions. Objective The objectives of the study were to assess biological status and dietary intakes of iron, zinc and vitamin A among women and children aged 36-59 months in rural Burkina Faso and to study relationships between intake and status to better inform future food-based interventions. Design A cross-sectional survey was carried out in two rural provinces of Burkina Faso on a random cluster sample of 480 mother-child pairs. Dietary data was obtained by 24-hour recalls repeated on a random sub-selection of 37.5% of subjects to allow calculation of nutrient's probability of adequacy (PA). Biomarkers were measured on a sub-sample of 180 mother-child pairs. Blood samples were analyzed for hemoglobin, serum ferritin, soluble transferrin receptors (sTfR), C-reactive protein, alpha-1-glycoprotein, serum zinc concentration (SZnC) and retinol. For each micronutrient the relationship between biomarker and dietary intake was investigated by multiple linear regression models accounting for inflammatory biomarkers. Results Mean PA for iron, zinc and vitamin A was 0.49, 0.87 and 0.21 among women and 0.61, 0.95 and 0.33 among children, respectively. Prevalence of anemia, corrected low serum ferritin and high sTfR was 37.6%, 4.0% and 77.5% among women and 72.1%, 1.5% and 87.6% among children, respectively. Prevalence of low SZnC and corrected low serum retinol was 39.4% and 12.0% among women and 63.7% and 24.8% among children, respectively. There was a tendency for a positive relationship between vitamin A intakes and serum retinol among women (beta = 0.0003, P = 0.06). Otherwise, no link was found between micronutrients biomarkers and intakes. Conclusion Our study depicted different images of micronutrient deficiencies when based on dietary intakes or biomarkers results, thus highlighting the need for more suitable biomarkers and more precise measures of absorbable micronutrient intakes at the individual level. It thus points to challenges in the design and evaluation of future biofortification or other food-based interventions in rural areas of Burkina Faso

Dynamic of plasmodium falciparum chloroquine resistance transporter gene Pfcrt K76T mutation five years after withdrawal of chloroquine in Burkina Faso

We investigated the evolution of Pfcrt K76T mutation five years after the withdrawal of chloroquine in Burkina Faso. A total of 675 clinical isolates collected from October 2010 to September 2012 were successfully genotyped. Single nucleotide polymorphism in Pfcrt (codon 76) gene was analyzed. The prevalence of resistant Pfcrt 76T allele was 20.55%. There was a progressive decrease of the proportion of mutant type pfcrt T76 from 2010 to 2012 (X2=5.508 p=0.0189). Our results suggest a progressive return of the wild type Pfcrt K76 in Burkina Faso but the prevalence of the mutants Pfcrt T76 still remains high